Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT27Q7Z3Y8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KRT27Q7Z3Y8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms