Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tnfsf18Q7TS55 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tnfsf18Q7TS55 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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