Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms