Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lcn3Q62471 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lcn3Q62471 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms