Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYL7

TMEM196, Transmembrane protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM196Q5HYL7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM196Q5HYL7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM196Q5HYL7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms