Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LbrQ3U9G9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LbrQ3U9G9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LbrQ3U9G9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms