Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN9AQ15858 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
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