Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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