Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
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