Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SHPRHQ149N8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHPRHQ149N8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
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