Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKP1Q13835 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKP1Q13835 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
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