Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	snR3	snR3	194 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	GLN4	YOR168W	2430 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	FAA1	YOR317W	2103 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	LAP3	YNL239W	1365 nt		4.15	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	SSH4	YKL124W	1740 nt		4.15	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	YDL027C	YDL027C	1263 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YGR011W	YGR011W	327 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	MAD2	YJL030W	591 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	OAR1	YKL055C	837 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	ERG3	YLR056W	1098 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	SWC7	YLR385C	399 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YMR130W	YMR130W	909 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YMR147W	YMR147W	672 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	SPS19	YNL202W	879 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	HOS2	YGL194C	1359 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	IXR1	YKL032C	1794 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	NOP8	YOL144W	1455 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	MRPL25	YGR076C	474 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	RAD27	YKL113C	1149 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YOR289W	YOR289W	756 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	STP22	YCL008C	1158 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	WHI4	YDL224C	1950 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	NTH1	YDR001C	2256 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	TDA6	YPR157W	1404 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YER145C-A	YER145C-A	438 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YGL088W	YGL088W	366 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YGL188C	YGL188C	174 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YIL165C	YIL165C	360 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	LOH1	YJL038C	660 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	SIW14	YNL032W	846 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	ARG8	YOL140W	1272 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	BIK1	YCL029C	1323 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	GSH2	YOL049W	1476 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	UBP6	YFR010W	1500 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	MAD3	YJL013C	1548 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	ADP1	YCR011C	3150 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YIL171W	YIL171W	330 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YLR283W	YLR283W	945 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	SHE1	YBL031W	1017 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	RDH54	YBR073W	2877 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	RPO31	YOR116C	4383 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	IRC7	YFR055W	1023 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	SPO74	YGL170C	1242 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	GVP36	YIL041W	981 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	MRS3	YJL133W	945 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	NMA1	YLR328W	1206 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YBL059W	YBL059W	582 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YIF1	YNL263C	945 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	FSH3	YOR280C	801 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	GRS2	YPR081C	1857 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	PRP19	YLL036C	1512 nt		4.11	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YBL029W	YBL029W	1131 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	SPT23	YKL020C	3249 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	FAS2	YPL231W	5664 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	RTC1	YOL138C	4026 nt		4.1	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	IMG2	YCR071C	441 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	AAD6	YFL056C	639 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	RPL24A	YGL031C	468 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	SKI8	YGL213C	1194 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	SPO12	YHR152W	522 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YHR214W	YHR214W	612 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YAR066W	YAR066W	612 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	URE2	YNL229C	1065 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	UTP23	YOR004W	765 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	FEX1	YOR390W	1128 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	FEX2	YPL279C	1128 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	MUM3	YOR298W	1440 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	IBA57	YJR122W	1494 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	NOP58	YOR310C	1536 nt		4.09	□□□□□ -1.75
VIK1	Q12045	YER134C	YER134C	537 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	SPI1	YER150W	447 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	tQ(UUG)C	tQ(UUG)C	72 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	tQ(UUG)D1	tQ(UUG)D1	72 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	tQ(UUG)D2	tQ(UUG)D2	72 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	tQ(UUG)D3	tQ(UUG)D3	72 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	tQ(UUG)E1	tQ(UUG)E1	72 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	tQ(UUG)H	tQ(UUG)H	72 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	tQ(UUG)L	tQ(UUG)L	72 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	GRE3	YHR104W	984 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YIL001W	YIL001W	1542 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	ISY1	YJR050W	708 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YBR196C-B	YBR196C-B	105 nt		4.08	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	MNL1	YHR204W	2391 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	PRM1	YNL279W	1986 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	CIN5	YOR028C	888 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	COA2	YPL189C-A	207 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	PRE2	YPR103W	864 nt		4.07	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	LAS1	YKR063C	1509 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	APM1	YPL259C	1428 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YDL183C	YDL183C	963 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YEL028W	YEL028W	462 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	AST1	YBL069W	1290 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YGP1	YNL160W	1065 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	TAF7	YMR227C	1773 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	JHD2	YJR119C	2187 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	TRK1	YJL129C	3708 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YTM1	YOR272W	1383 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	SEO1	YAL067C	1782 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	INO2	YDR123C	915 nt		4.05	□□□□□ -1.76

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