Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc2Q05020 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms