Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P58686 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P58686 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P58686 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P58686 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P58686 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P58686 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P58686 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P58686 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P58686 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P58686 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P58686 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P58686 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P58686 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P58686 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P58686 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P58686 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P58686 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P58686 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
P58686 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P58686 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P58686 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P58686 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P58686 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P58686 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P58686 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P58686 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P58686 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P58686 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P58686 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P58686 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P58686 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P58686 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P58686 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P58686 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P58686 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P58686 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P58686 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P58686 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P58686 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P58686 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P58686 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
P58686 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P58686 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P58686 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P58686 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P58686 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P58686 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P58686 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P58686 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P58686 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P58686 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P58686 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P58686 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P58686 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P58686 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
P58686 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P58686 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P58686 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P58686 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P58686 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P58686 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P58686 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P58686 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P58686 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
P58686 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P58686 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P58686 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P58686 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P58686 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P58686 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P58686 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P58686 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P58686 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P58686 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P58686 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms