Protein–RNA interactions for Protein: P52800

Efnb2, Ephrin-B2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb2P52800 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb2P52800 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb2P52800 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms