Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clec3bP43025 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Clec3bP43025 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms