Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tac1P41539 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tac1P41539 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tac1P41539 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tac1P41539 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tac1P41539 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tac1P41539 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms