Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALB2P22676 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALB2P22676 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALB2P22676 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALB2P22676 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CALB2P22676 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALB2P22676 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALB2P22676 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALB2P22676 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALB2P22676 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALB2P22676 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALB2P22676 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CALB2P22676 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALB2P22676 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALB2P22676 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALB2P22676 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALB2P22676 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CALB2P22676 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALB2P22676 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CALB2P22676 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALB2P22676 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALB2P22676 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALB2P22676 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALB2P22676 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALB2P22676 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALB2P22676 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALB2P22676 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALB2P22676 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALB2P22676 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALB2P22676 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALB2P22676 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALB2P22676 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALB2P22676 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALB2P22676 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALB2P22676 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CALB2P22676 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALB2P22676 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALB2P22676 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALB2P22676 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CALB2P22676 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALB2P22676 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALB2P22676 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALB2P22676 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALB2P22676 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALB2P22676 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALB2P22676 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALB2P22676 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALB2P22676 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALB2P22676 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALB2P22676 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALB2P22676 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALB2P22676 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALB2P22676 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALB2P22676 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALB2P22676 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms