Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD2P0DJD1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms