Protein–RNA interactions for Protein: P09630

HOXC6, Homeobox protein Hox-C6, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6P09630 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXC6P09630 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC6P09630 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms