Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT38O76015 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT38O76015 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT38O76015 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT38O76015 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT38O76015 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT38O76015 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT38O76015 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT38O76015 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT38O76015 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT38O76015 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT38O76015 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT38O76015 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT38O76015 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT38O76015 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT38O76015 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT38O76015 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT38O76015 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT38O76015 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT38O76015 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT38O76015 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT38O76015 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT38O76015 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT38O76015 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT38O76015 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT38O76015 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT38O76015 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT38O76015 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT38O76015 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT38O76015 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT38O76015 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT38O76015 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT38O76015 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT38O76015 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT38O76015 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT38O76015 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT38O76015 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT38O76015 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT38O76015 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT38O76015 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT38O76015 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT38O76015 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT38O76015 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT38O76015 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT38O76015 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT38O76015 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT38O76015 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT38O76015 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT38O76015 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT38O76015 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT38O76015 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT38O76015 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT38O76015 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT38O76015 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT38O76015 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT38O76015 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms