Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BBOX1O75936 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BBOX1O75936 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BBOX1O75936 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BBOX1O75936 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BBOX1O75936 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BBOX1O75936 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BBOX1O75936 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BBOX1O75936 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BBOX1O75936 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BBOX1O75936 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BBOX1O75936 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BBOX1O75936 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
BBOX1O75936 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
BBOX1O75936 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BBOX1O75936 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BBOX1O75936 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BBOX1O75936 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BBOX1O75936 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BBOX1O75936 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BBOX1O75936 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BBOX1O75936 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BBOX1O75936 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BBOX1O75936 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BBOX1O75936 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BBOX1O75936 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BBOX1O75936 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BBOX1O75936 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BBOX1O75936 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BBOX1O75936 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BBOX1O75936 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BBOX1O75936 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BBOX1O75936 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BBOX1O75936 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BBOX1O75936 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BBOX1O75936 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BBOX1O75936 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BBOX1O75936 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BBOX1O75936 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BBOX1O75936 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BBOX1O75936 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms