Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACOX3O15254 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACOX3O15254 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACOX3O15254 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACOX3O15254 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACOX3O15254 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACOX3O15254 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms