Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHUKO15111 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHUKO15111 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHUKO15111 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHUKO15111 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHUKO15111 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHUKO15111 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHUKO15111 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHUKO15111 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHUKO15111 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHUKO15111 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHUKO15111 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHUKO15111 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHUKO15111 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHUKO15111 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHUKO15111 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHUKO15111 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHUKO15111 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHUKO15111 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHUKO15111 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHUKO15111 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHUKO15111 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHUKO15111 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHUKO15111 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHUKO15111 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHUKO15111 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHUKO15111 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHUKO15111 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHUKO15111 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHUKO15111 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHUKO15111 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHUKO15111 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHUKO15111 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHUKO15111 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHUKO15111 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHUKO15111 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHUKO15111 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHUKO15111 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHUKO15111 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHUKO15111 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHUKO15111 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHUKO15111 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHUKO15111 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHUKO15111 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHUKO15111 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHUKO15111 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHUKO15111 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHUKO15111 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHUKO15111 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHUKO15111 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHUKO15111 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHUKO15111 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHUKO15111 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHUKO15111 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHUKO15111 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHUKO15111 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHUKO15111 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHUKO15111 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHUKO15111 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHUKO15111 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHUKO15111 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHUKO15111 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHUKO15111 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHUKO15111 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHUKO15111 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHUKO15111 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHUKO15111 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHUKO15111 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHUKO15111 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHUKO15111 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHUKO15111 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHUKO15111 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHUKO15111 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHUKO15111 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHUKO15111 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHUKO15111 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHUKO15111 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHUKO15111 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHUKO15111 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHUKO15111 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHUKO15111 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHUKO15111 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHUKO15111 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHUKO15111 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHUKO15111 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHUKO15111 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHUKO15111 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHUKO15111 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHUKO15111 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHUKO15111 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHUKO15111 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHUKO15111 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHUKO15111 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHUKO15111 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHUKO15111 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHUKO15111 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHUKO15111 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHUKO15111 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHUKO15111 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHUKO15111 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms