Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm21818J3KMS6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm21818J3KMS6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm21818J3KMS6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Gm21818J3KMS6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Gm21818J3KMS6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Gm21818J3KMS6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21818J3KMS6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Gm21818J3KMS6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Gm21818J3KMS6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Gm21818J3KMS6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Gm21818J3KMS6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Gm21818J3KMS6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Gm21818J3KMS6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm21818J3KMS6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm21818J3KMS6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gm21818J3KMS6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gm21818J3KMS6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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