Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc71lE9Q4T4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc71lE9Q4T4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc71lE9Q4T4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc71lE9Q4T4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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