Protein–RNA interactions for Protein: E9PWQ3

Col6a3, Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3E9PWQ3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a3E9PWQ3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a3E9PWQ3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a3E9PWQ3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a3E9PWQ3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a3E9PWQ3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a3E9PWQ3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a3E9PWQ3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a3E9PWQ3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a3E9PWQ3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col6a3E9PWQ3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col6a3E9PWQ3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms