Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm17333C6EQI3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17333C6EQI3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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