Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
4931406B18RikA2RSL7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4931406B18RikA2RSL7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms