Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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