Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVV-2B6SEH9 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms