Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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AP3M2P53677 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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AP3M2P53677 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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AP3M2P53677 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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AP3M2P53677 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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AP3M2P53677 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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AP3M2P53677 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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