Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
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