Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ubash3bQ8BGG7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ubash3bQ8BGG7 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ubash3bQ8BGG7 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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