Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms