Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC018868.2-201ENST00000559655 1259 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TNNT2-201ENST00000236918 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TCP10L-202ENST00000472557 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC080038.2-201ENST00000617734 423 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 RN7SL483P-201ENST00000478417 285 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 RN7SL624P-201ENST00000580297 278 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CACNA1G-AS1-202ENST00000505793 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TSACC-203ENST00000368253 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TRGV4-201ENST00000390345 688 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 PIGA-209ENST00000634582 965 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AL133517.1-201ENST00000413412 748 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AC006967.2-201ENST00000426169 432 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AC079944.2-201ENST00000478867 734 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AC013472.3-201ENST00000607407 659 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 CD300LB-201ENST00000314401 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms