Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CntrobQ8CB62 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms