Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 WFDC2-202ENST00000339946 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 WFDC2-204ENST00000372676 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLA1P09884 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLA1P09884 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLA1P09884 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLA1P09884 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLA1P09884 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLA1P09884 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLA1P09884 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLA1P09884 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLA1P09884 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLA1P09884 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLA1P09884 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLA1P09884 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLA1P09884 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLA1P09884 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 HNRNPA1P30-202ENST00000440699 997 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AL359094.2-201ENST00000420941 750 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLA1P09884 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLA1P09884 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLA1P09884 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms