Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ZNF114-201ENST00000315849 2206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 LINC02381-202ENST00000635070 1341 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFTRP13569 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 FAM25E-201ENST00000411791 322 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AL133517.1-201ENST00000413412 748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 EEF1GP2-201ENST00000509352 1243 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFTRP13569 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SPTY2D1-AS1-202ENST00000511927 573 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC013472.3-201ENST00000607407 659 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFTRP13569 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms