Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms