Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrprbP47758 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms