Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB12Q9Y5F1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms