Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDZRN3Q9UPQ7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms