Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sall2Q9QX96 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sall2Q9QX96 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms