Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msrb1Q9JLC3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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