Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod2Q9JKK7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod2Q9JKK7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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