Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnga3Q9JJZ8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnga3Q9JJZ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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