Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FliiQ9JJ28 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FliiQ9JJ28 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms