Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ercc8Q8CFD5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.8 ms