Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx13Q6PHS6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx13Q6PHS6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx13Q6PHS6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms